中科院遗传与发育生物学研究所橡胶草科研进展

2018-8-28 10:41| 发布者: admin_1| 查看: 4225| 评论: 0|原作者: 徐霞

中科院遗传与发育生物学研究所在橡胶草基因组序列草图完成之后，又对橡胶草基因组组装拼接进行了优化，通过Pacbio三代单分子测序技术，Bionano光学图谱技术，Hi-C三维构象技术，和10× Genomics技术相结合，针对橡胶草自交不亲和、杂合度高达1.7%，重复序列高达70%的特点，优化基因组组装及拼接方法，以期达到构建出一套染色体级别的高质量橡胶草基因组序列图谱，为挖掘橡胶草产胶潜力构成性状的全基因组关联分析奠定基础。

橡胶草基因组升级分析

为收集更多的橡胶草种质资源，2018年6月份在新疆农业科学院农作物品种资源研究所所长徐麟研究员的大力支持下，与中国热带农业科学院橡胶研究所刘实忠研究员、覃碧老师、杨玉双老师一起赴新疆开展橡胶草种质资源调查收集工作。在新疆农业科学院农作物品种资源研究所张龑研究员和伊犁州农科所高级农艺师张学超老师带领下，对石河子地区，伊犁地区昭苏县、特克斯县、巩留县，库尔勒地区和静县、博湖县等地调查收集了橡胶草及野生蒲公英近缘种，为今后橡胶草基础研究及种质资源利用打下了良好的基础。

橡胶草与蒲公英具有抗旱、抗寒、耐盐碱、耐贫瘠等特征，可在中低产田、盐碱地等荒漠化土地种植。山东省东营市位于黄河入海口，土壤盐碱化程度严重，为挖掘此处的耐盐碱蒲公英种质资源及改良利用这片土地，我们首先收集了盐碱地区的蒲公英种质资源，并计划单株收种进行耐盐碱筛选。有关盐碱地中橡胶草的种植，由黑龙江省科学院曾祥俊书记馈赠大量俄罗斯蒲公英K445种子，和内蒙古多伦县教育科技局唐怀东局长馈赠部分俄罗斯蒲公英K445，K479种子以及短角蒲公英TB种子，因橡胶草种子非常宝贵，先少量直播试种，几乎没有出苗，因此采用先在温室育秧后栽种大田的方法，以期能够筛选到比较耐盐碱的橡胶草种质。

除了橡胶草基因组优化，以及橡胶草和蒲公英种质资源收集之外，有关橡胶草转基因突变体库构建及突变体基因功能验证工作也在进行中。我们挑选了部分与天然橡胶合成、乳管变化、抗胁迫等相关的突变体做进一步深入研究，相关转基因互补验证等工作正在进行中。